马来西亚公司不同税务申报的流程通常包括以下步骤：

1. 企业所得税

   - 提交估税表（CP204）：公司需估算年度应税收入，并按季度预缴税款。

   - 准备财务报表：在纳税年度结束后，公司需准备经过审计的财务报表。

   - 提交年度税务申报表（Form C）：将财务报表和相关文件提交给马来西亚国内税收局（IRB）。

   - 税款结算和支付：根据年度税务申报表的计算结果，结算实际应缴税款和已预缴税款之间的差额。

2. 销售税和服务税（Sales and Services Tax -SST）

   - 注册和申报：符合条件的企业需向海关局注册SST，并按季度提交申报表和缴纳税款。

3. 个人所得税

   - 代扣和申报：雇主需每月代扣雇员的个人所得税，并按年提交个人所得税申报表。